Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2021 , Vol 27 , Sayı 6
Development of a Multiplex PCR Assay for the Simultaneous Detection of Echinococcus spp. in Wild Canids in the Qinghai-Tibet Plateau Area of China
1Qinghai Academy of Animal Sciences and Veterinary Medicine, Qinghai University, Xining Qinghai, 810016, P.R. CHINA2Institute of Traditional Chinese Veterinary Medicine, College of Veterinary Medicine, Gansu Agricultural University, Lanzhou Gansu, 730070, P.R. CHINA DOI : 10.9775/kvfd.2021.26148 Echinococcus granulosus sensu stricto, E. multilocularis ve E. shiquicus enfeksiyonları, Çin"in Qinghai-Tibet Platosu bölgesindeki (QTPA) yabani köpekgillerde genellikle yaygın ve koendemik seyretmektedir. Bu nedenle, enfekte konakçıların tespiti ve Echinococcus türlerinin tanımlanması için etkili bir teşhis yöntemine ihtiyaç vardır. Bu çalışmada, bahsedilen bu üç temel Echinococcus türünün aynı anda tespit edilmesi ve Echinococcus enfeksiyonlarının teşhisi, önlenmesi ve kontrolü için teknik destek sağlayan bir multipleks PCR (mPCR) yönteminin geliştirilmesi amaçlandı. mPCR için, Echinococcus"un GenBank"ta mevcut olan mitokondriyal genlerine bağlı olarak üç çift spesifik primer tasarlandı ve bu primerlerin özgüllük ve duyarlılıkları doğrulanarak temsili koenfeksiyon örneklerinin tespiti ve saha örnekleri için kullanıldı. mPCR yöntemi, hem bireysel hem de karma hedef Echinococcus"ları başarıyla tanımladı ve her tür için farklı boyutlarda beklenen amplikonlar oluşturdu. mPCR yönteminin duyarlılığı, seyreltilmiş gen rekombinant plazmidi ile test edildi ve her iki grup için 103"ten daha düşük bir saptama eşik değeri gösterdi. Diğer 10 parazite karşı değerlendirilerek, yöntemin spesifitesi %100 saptandı. mPCR yöntemi ayrıca temsili 15 klinik örnekte test edildi ve geliştirilen bu yönteminin QTPA"da klinik örneklerin analizinde kullanılabilecek yüksek güvenilirliğe sahip olduğu doğrulandı. Geliştirilen bu mPCR yönteminin, hızlı tespit, teşhis ve geniş ölçekli tarama çalışmalarında potansiyelinin olduğu saptanmıştır ve böylelikle klinik tespit ve çevresel izleme için kilit bir teknoloji olması beklenmektedir. Anahtar Kelimeler : Echinococcus granulosus, Echinococcus multilocularis, Echinococcus shiquicus, Multipleks PCR, Çin