Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2022 , Vol 28 , Issue 6
Molecular Characterization of Pseudomonas aeruginosa Isolated From Clinical Bovine Mastitis Cases
Özkan ASLANTAŞ1, Süheyla TÜRKYILMAZ2, Oktay KESKİN3, Ayfer GÜLLÜ YÜCETEPE3, Kaan BÜYÜKALTAY4
1Hatay Mustafa Kemal University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Microbiology, TR-31060 Hatay - Türkiye
2Aydın Adnan Menderes University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Microbiology, TR-09010 Aydın - Türkiye
3Harran University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Microbiology, TR-63290 Şanlıurfa - Türkiye
4Middle East Technical University, Bioinformatic Institute, TR-06800 Ankara - Türkiye DOI : 10.9775/kvfd.2022.28118 Bu çalışmada klinik sığır mastitis vakalarından izole edilen 44 Pseudomonas aeruginosa izolatının virülans genlerinin varlığı ve dağılımı ile antimikrobiyal duyarlılıklarının araştırılması amaçlandı. Ayrıca, seçilen 6 P. aeruginosa izolatının tüm genom dizileme (WGS) ile taslak genomları elde edilerek daha detaylı karakterizasyonları yapıldı. T3SS ilişkili genlerin varlığına dayalı olarak, izolatların %25"inin invaziv (exoU-/exoS+, %18.2) ve sitotoksik (exoU+/exoS-, %6.8) suşlara ait exoU ve/veya exoS genleri taşıdığı belirlendi. Ancak izolatların hiçbirinde exoU ve exoS genleri birlikte tespit edilmedi. İncelenen diğer virülans genleri açısından ise izolatlar arasında çeşitli virülans gen profilleri gözlendi. İzolatların çoğu (%72.7) incelenen tüm antimikrobiyallere duyarlı bulundu. Siprofloksasin ve karbapenemlere (imipenem ve meropenem) direnç oranları sırasıyla %25 ve %4.5 olarak belirlendi. WGS analizi tüm izolatlarda farklı rezistomun, gyrA, parC, oprD, efflux pump ve ampC gen ekspresyonunun regulasyonunda rol oynayan genlerde farklı mutasyon kombinasyonlarının varlığını gösterdi. Seçilen izolatlarda ciddi bir halk sağlığı tehdidi oluşturan ve dünya çapında çoklu ilaç dirençli yüksek riskli O11-ST235 klonu dahil farklı sekans tipleri (ST) ve serotipleri bulundu. Bu çalışmanın bulguları, klinik sığır mastitis vakalarından izole edilen P. aeruginosa suşlarının mevcut antimikrobiyal direnç düzeyleri ve virülans determinantları hakkında değerli bilgiler sunmaktadır. Keywords : Antimikrobiyal direnç, Klinik inek mastitis, Pseudomonas aeruginosa, Virulens, Tüm genom dizileme