¹First Affiliated Hospital of School of Medicine, Shihezi University, Shihezi 832000, CHINA
²School of Chemistry and Chemical Engineering, Shihezi University, Xinjiang, 832003, CHINA
³School of Animal Science and Technology, Shihezi University, Shihezi 832000, CHINA DOI : 10.9775/kvfd.2021.26373 Bulaşıcı Gastroenterit Virüs (TGEV) enfeksiyonu, domuz yavrularında ishalin önde gelen nedenlerinden birisidir. Bağırsaklardaki bağışıklık sistemi, mukozal bütünlüğün korunması ve patojenlerin neden olduğu enfeksiyonlara karşı koymada önemli bir rol oynar. Ancak, TGEV enfeksiyonunun neden olduğu bağışıklık yanıt ile hastalığın ilerlemesi arasındaki ilişki açık değildir. Gene Expression Omnibus veri tabanından GSE41756 mikroarray veri setini kullanarak, 6 ve 12 saatlik TGEV enfeksiyonunda domuz ince bağırsak epitel hücrelerini analiz ettik. Diferansiyel gen ekspresyonları (DEGs), "limma" R paketi kullanılarak tespit edildi. Tespit edilen DEG"lerin, Gen Ontology, Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi yolak zenginleştirme ve protein-protein etkileşim ağı ile analizleri gerçekleştirildi. Kesişim noktasından sonra 56 DEG (ekspresyonu artmış 47 gen ve ekspresyonu azalmış 9 gen) saptadık. Yolak zenginleştirme analizi, DEG"lerin esasen immun yanıt, ekstraselüler boşluk, sitokin aktivitesi ve çekirdeğe nükleer faktör-κB girişinin pozitif yönde düzenlenmesi ile ilişkili olduğunu ortaya koydu. Bu, tümör nekrozis faktör sinyal yolu, inflamatuar bağırsak hastalığı ve influenza A"daki DEG"ler arasındaki güçlü ilişkileri ortaya çıkardı. İnterlökin 6 (IL6), IL8, IL18, tümör nekrozis faktör ve toll-like reseptör asıl genleri, TGEV enfeksiyonu sırasında önemli roller oynayabilir. Keywords : DEGs, İmmün yanıt, TGEV, TNF, TLR2e