This journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2020 , Vol 26 , Issue 2
Detection and Molecular Characterization of BCoVs Circulating in Central China Based on the Full-length Spike Gene
1Institute of Animal Husbandry and Veterinary, Henan Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou, 450002, Henan, CHINA2College of Pharmaceutical Engineering, Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou, 450046, Henan, CHINA
3Henan Key Laboratory of Farm Animal Breeding and Nutritional Regulation, Zhengzhou, 450002, Henan, CHINA
4Department of Pathology and Laboratory Medicine, Tulane University Medical School, 70112, New Orleans, USA DOI : 10.9775/kvfd.2019.22678 Sığır koronavirüs (BCoV) tüm dünyada yaygındır ve yeni doğmuş buzağılarda ishal olgularının etiyolojisinde önemli rol oynar. Bununla birlikte, Çin"de BCoV"nin genetik çeşitliliği ve moleküler epidemiyolojisi hakkında çok az şey bilinmektedir. Bu çalışmada, 2017 ile 2018 yılları arasında Orta Çin"in Henan eyaletindeki dokuz ilden ishalli süt buzağılarından toplam 127 adet dışkı örneği toplandı ve N geni için RT-PCR ile değerlendirildi. Buzağıların %15"inde (19/127) BCoV tespit edildi. Ek olarak, 13 temsilci BCoV suşundan S geninin tam uzunluktaki dizisi elde edildi ve analiz edildi. Tam uzunluktaki S geni için sıralama sonuçları, klasik Mebus suşu ile %97.3-97.5 nükleotit (nt) özdeşliği ve %96.3-96.8 amino asit (aa) özdeşliği gösterdi. Tam uzunluktaki S genine dayanan filogenetik analiz, bu çalışmada BCoV suşlarının, ağacın büyük bir dalında Vietnam ve Küba BCoV suşları ile kümelendiğini gösterdi. Bu sonuçlar, Orta Çin"in Henan Eyaletindeki ishalli buzağılarda BCoV suşlarının moleküler karakterizasyonunu zenginleştirerek BCoV prevalansının ilk büyük ölçekli epidemiyolojik incelenmesini sağlamış oldu. Keywords : BCoV, Spike geni, Filogenetik analiz, Çin