Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Issue 6
Identification and Genetic Characterization of Astrovirus in Wild Boar (Sus scrofa) in China
Fan-fan ZHANG1, Yu-xin TANG1, Yu YE1, Nannan GUO1, Min ZHANG1, Hao LI1, Dan LEI1, Qiong WU1, Dong-yan HUANG1, De-ping SONG1
1Key Laboratory for Animal Health of Jiangxi Province, 330045, Nanchang, Jiangxi, CHINA
2Department of Veterinary Preventive Medicine, College of Animal Science and Technology, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, Jiangxi, CHINA
DOI : 10.9775/kvfd.2018.20139 Domuz astrovirusu (PAstV) dünya çapında ishalli domuzlarda en sıklıkla belirlenen bir virustur. Bu çalışmada, Çin"in Jiangxi eyaletinde yaban domuzunda (Sus scrofa) astrovirusun ilk tespiti ve tüm genom sekans analizi gerçekleştirilmiştir. Astrovirus WBAstV/CH/2015"un tüm genom sekansı amplifiye edildi ve belirlendi. Sekans homoloji analizi, WBAstV/CH/2015"in dünye çapında PAstVları ile %40.8 ile %79.7 arasında benzerliğe sahip olduğunu ve Macaristan"da tespit edilen diğer bir yaban domuzu astrovirus (WBAstV) suşu olan WBAstV-1/2011/HUN ile en yüksek benzerliğe (%79.7) sahip olduğunu gösterdi. Filogenetik analiz WBAstV/CH/2015"in WBAstV-1/2011/HUN ile yakın akraba olduğunu ve PAstV 4 topluluğuna yakın olarak yer aldığını göstermiştir. Keywords : Domuz astrovirusu (PAstV), İshal, Yaban domuzu (Sus scrofa), Genom, Filogenetik analiz