Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Issue 3
Identified Novel Deletions in the Genomes of Avian Endogenous Retroviruses ev/J in Chicken Breeds in China
Xiongyan LIANG1, Lan LIU1, Chun FANG1, Yufang GU1, Tuofan LI1, Yuying YANG1
1College of Animal Science, Yangtze University, No. 88 Jingmi Rd., Jingzhou 434025, Hubei, P. R. CHINA DOI : 10.9775/kvfd.2017.19079 Avian lökozis virus subgroup J (ALV-J) enfeksiyonu tümör ve immunosuprasyona neden olarak kanatlı sektöründe önemli finansal kayıpların oluşmasına yol açabilir. Eksojen avian lökozis virus ve endojen retroviruslardan rekombine edilen yeni patojenik avian lökozis viruslar her gün Çin ve dünyanın diğer bölgelerinden izole edilmektedir. Potansiyel rekombinant elementlerin özelliklerini açığa çıkarmak amacıyla Çin"de on farklı tavuk cinsinden avian endojen retrovirus ev/J"nin genomları analiz edildi. On cinsten altısında iki farklı ev/J büyüklüğü (3.8 kb ve 2.2 kb) tespit edilirken diğerlerinde sadece 3.8 kb ev/J mevcuttu. Filogenetik ağaçta on 3.8 kb ev/J tip I, II ve III ev/J prototiplerine çok daha yakın iken altı 2.2 kb ev/J ise tip IV ev/J prototipine yakındı. Çin"de on altı tavuk sürüsünde ev/J"de üç yeni delesyon parçacıkları belirlendi. Bu durum çoğu ev/J (10/16)"yi anlamlı derecede dört ev/J prototipinden farklı kılmaktadır. Bu yeni delesyonların meydana gelmesi Çin"de tavuk cinsleri arasında ev/J"de farklılığın oluşmasına neden olarak özellikle eksojen ALV subgrup J olmak üzere avian lökozis viruslarda ileri rekombinasyonların kaynağını oluşturabilir. Keywords : Avian endojen retrovirus, ev/J, Avian lökozis virus, Genom, Tavuk cinsleri