Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2021 , Vol 27 , Sayı 4
Evaluation of the Analytical Efficiency of Real-Time PCR in the Diagnosis of Brucellosis in Cattle and Sheep
Derya KARATAŞ YENİ1, Doğan AKÇA2
1Veterinary Control Central Research Institute, Breeding Disease Laboratory, TR-06100 Ankara - TURKEY
2Kafkas University, Faculty of Health Science, Department of Midwifery, TR-36300 Kars - TURKEY
DOI : 10.9775/kvfd.2021.25776 Brusellozis, ülkemizle birlikte gelişmekte olan birçok ülkede hayvanlarda ve halk sağlığı açısından önem arzeden infeksiyöz bir hastalıktır. Brusellozisin, kontrol ve eradikasyonunda hızlı ve güvenilir teşhis imkânı sunan yöntemlere her zaman ihtiyaç duyulmaktadır. Bu kapsamda, bakterilerin korunaklı gen bölgelerinin enzimatik amplifikasyonunu sağlayan moleküler yöntemler avantaj sağlamaktadır. Bu çalışmada, İç Anadolu ve Karadeniz Bölgelerine ait farklı yerleşim birimlerindeki brusellozis riski taşıyan işletmelerden laboratuvarımıza gönderilen sığır ve koyunlara ait kan serum örnekleri incelenmiştir. Çalışmamızda, brusellozisin serolojik yöntemler ve Real-Time PCR (RT-PCR) ile araştırılması ve bu yöntemlerin karşılaştırmalı analizi amaçlanmıştır. Bu amaçla, RBPT, SAT ve KFT testleri ile birlikte tüm Brucella türlerinde bulunan BCSP31 geninin amplifikasyonunu sağlayan Brusella RT-PCR metodu kullanılmıştır. İncelenen 368 serum örneğinde RBPT, SAT ve KFT ile Brucella pozitifl iği sırayla %11.41, %10.05 ve %9.8 belirlenirken, RT-PCR analizi sonucu, KFT ile aynı oranda (%9.8) pozitifl ik elde edilmiştir. KFT referans test olarak dikkate alındığında, RT-PCR"nin sensitivite, spesifite, pozitif ve negatif prediktif değerleri ve tanı doğruluğu %100 ve 1.000"lık kappa değeri ile KFT ile mükemmel derecede uyumlu olduğu saptanmıştır. Brucella melitensis biyotip 3 (Ether) referans suşuna ait DNA eşliğinde RT-PCR ile saptanabilen bakteriyel genom sayısı 3.94x103 kopya olarak belirlenmiştir. Gerçekleştirilen linear regresyon analizi ile RTPCR"nin amplifikasyon verimliliği, istenen sınırlar (%90-110) arasında (%92.71) yer almış ve tekrarlanabilir (CV %2.9) ve üretilebilir (CV %1.8) olduğu belirlenmiştir. Bu çalışma ile yüksek analitik verimliliği sayesinde RT-PCR"nin sığır ve koyun brusellozisin teşhisinde başvurulabilir bir yöntem olduğu öngörülmüş ve bu kapsamda kan serum örneklerinin tercih edilebilir klinik materyaller olarak önemi vurgulanmıştır. Anahtar Kelimeler : Brucella spp., Brusellozis, Sığır, Koyun, Real-Time PCR, Analitik yeterlilik