Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2020 , Vol 26 , Sayı 2
Genetic Polymorphism of STAT1 and STAT5A Genes in Holstein, Jersey, and Indigenous Cattle Breeds in Turkey
Ozden COBANOGLU1, Ertugrul KUL2, Samet Hasan ABACI3, Eser Kemal GURCAN4, Soner CANKAYA5
1Department of Genetics, Faculty of Veterinary-Medicine, University of Uludag, TR-16059 Bursa - TURKEY
2Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Kırşehir Ahi Evran, TR-40200 Kırşehir - TURKEY
3Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Ondokuz Mayis, TR-55139 Samsun - TURKEY
4Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Namik Kemal, TR-59030 Tekirdağ - TURKEY
5Department of Sport Management, Faculty of Yaşar Doğu Sport Sciences, University of Ondokuz Mayis, TR-55139
DOI : 10.9775/kvfd.2019.22908 Bu çalışma, Türkiye"de süt sığırları ve bazı yerli sığır ırklarında STAT1 ve STAT5A genlerine ait genetik polimorfizmin belirlenmesini amaçlamaktadır. Araştırma kapsamında, 283 Jersey ve iki farklı sürüden toplam 472 Siyah Alaca inekleri ile 93 Boz Irk, 85 Yerli Kara ve 66 Doğu Anadolu Kırmızısı sığırları kullanılmıştır. Genel olarak, tüm ırklarda C allel gen frekansı STAT1 için T allelinden daha yüksek olurken Jersey ve Doğu Anadolu Kırmızısı"n da ise C allel gen frekansı STAT5A için G allelinden daha yüksektir. Diğer yandan ise, G allel gen frekansı Siyah Alaca, Boz Irk ve Yerli Kara ırklarında C allelinden daha yüksektir. Hardy-Weinberg Dengesinden beklenen sapmalar sadece STAT1 genin için Jersey ırkında önemlidir. Ayrıca, STAT5A geni için dengeden beklenen sapma Karadeniz Bölgesi"nde (KB) ki Siyah Alacalar, Yerli Kara ve Boz Irkları için de anlamlı derecede farklıdır. FIS değerleri, STAT1 geni bakımından Marmara Bölgesi"nde (MB) ki Siyah Alacalar dışında bütün ırklar için negatif olarak belirlenmiştir. Benzer şekilde, bu değer, STAT5A geni bakımından KB"de ki Siyah Alacalar hariç bütün ırklar için pozitif olarak belirlenmiştir. İki lokusun genetik mesafeleri tüm popülasyonlar bakımından 0.0029 ile 0.1599 arasında hesaplanmıştır. Kümeleme analizine bağlı olarak, KB ve MB"de ki Siyah Alacalar, Yerli Kara, Doğu Anadolu Kırmızısı birbirlerine çok yakın kümelenmişken, Boz Irk ve Jersey ırkları tamamen farklı kümeler de yer almıştır. Sonuç olarak, STAT1 ve STAT5A genlerinde tespit edilen genetik çeşitliliğe dayanarak Türkiye"de yetiştirilen büyükbaş hayvan ırkları arasında genetik bir iyileştirme yapılması mümkün görülmektedir. Anahtar Kelimeler : Sığır, Genetik polimorfizm, Genetik ilişkiler, STAT1, STAT5A