Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2019 , Vol 25 , Sayı 6
Investigation of Genetic Structures of Coloured Horses by mtDNA D-loop Sequence Analysis in Turkey
Abdurrahman KOSEMAN1, Yusuf OZSENSOY2, Metin ERDOGAN3, Cevdet YARALI4, Burhan TOPRAK4, Kemal ZENGIN4, İbrahim SEKER5
1Department of Crop and Animal Production, Akcadag Vocational School, Malatya Turgut Özal University, TR-44210 Malatya - TURKEY
2Department of Veterinary Biometrics and Genetics, Faculty of Veterinary Medicine, Sivas Cumhuriyet University, TR-58140 Sivas - TURKEY
3Department of Medical Biology and Genetics, Faculty of Veterinary Medicine, Afyon Kocatepe University, TR-03200 Afyonkarahisar - TURKEY
4Etlik Veterinary Control Central Research Institute, TR-06100 Ankara - TURKEY
5Department of Veterinary Zootechny, Faculty of Veterinary Medicine, Firat University, TR-23119 Elazig - TURKEY
DOI : 10.9775/kvfd.2019.21844 Bu çalışma, Türkiye"deki Alaca atların mtDNA D-Loop dizi analizi ile genetik yapılarının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Araştırmada, toplam 28 Alaca at incelenmiştir. Alınan kan örneklerinden DNA izolasyon kiti kullanılarak DNA elde edilmiş ve 519 bp uzunluğundaki mtDNA D-loop bölgesi PZR ile çoğaltılmış ve kapiller elektroforez sisteminde dizileme işlemi yapılmıştır. MEGA4 paket programı kullanılarak populasyon parametreleri ve filogenetik ağaçları çizilmiştir. Ayrıca farklı ülke at populasyonlarına ait DNA dizileri ile de karşılaştırılması yapılmıştır. Araştırmada, 42 farklı polimorfizm bölgesi ve 10 farklı haplogrup elde edilmiştir. Ayrıca Tajima D değeri -0.31 elde edilmiş ve populasyon genişlemesi olduğu belirlenmiştir. Örnekler arasındaki baz faklılıklarının 0.000 ile 0.032 arasında değiştiği belirlenmiştir. Çizilen filogenetik ağaçlar sonucunda örneklerin birbirlerinden farklı kümeler oluşturduğu ve farklı ülke populasyonları ile de iç içe girdiği belirlenmiştir. Ayrıca, bazı örneklerin farklı ülke atlarından tamamen ayrı noktalarda kendi populasyonunu oluşturduğu da gözlenmiştir. Sonuç olarak çalışılan populasyondaki örneklerin genetik yapılarının birbirinden farklı olduğu ve farklı analardan köken aldıkları görülmüştür. Elde edilen sonuçlara göre; Alaca atların Türkiye"ye ait yerli bir ırk olabileceği düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler : Alaca at, D-loop bölgesi, Haplogrup, Mitokondrial DNA