Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Sayı 4
Investigation of the Calculus Microbiome in Canines and Felines Using Next-Generation Sequencing
Tiwaporn RADEEROM1, Kriangkrai THONGKORN1, Kittisak BUDDHACHAT2, Waranee PRADIT4, Siriwadee CHOMDEJ4, Puntita SIENGDEE2, Korakot NGANVONGPANIT2
1Department of Companion Animal and Wildlife Clinic, Faculty of Veterinary Medicine, Chiang Mai University, Chiang Mai 50100, THAILAND
2Excellence Center in Veterinary Biosciences, Chiang Mai University, Chiang Mai 50200, THAILAND
3Department of Biology, Faculty of Science, Naresuan University, Phitsanulok 65000, THAILAND
4Department of Biology, Faculty of Science, Chiang Mai University, Chiang Mai 50200, THAILAND
5Department of Veterinary Biosciences and Veterinary Public Health, Faculty of Veterinary Medicine, Chiang Mai University, Chiang Mai 50100, THAILAND
DOI : 10.9775/kvfd.2018.19690 Köpek ve kedilerin ağız boşluğu yüzlerce bakteri türü tarafından kolonize edilmiştir. Bu çalışmada; köpek ve kedilerin diş taşlarının bakteriyal kompozisyonu tanımlanmıştır. 43 köpek ve 4 kediye ait diş taşı örnekleri dört faklı grupta toplandı. Köpekler üç grupta kategorize edildi: küçük olmayan ırk köpekler, brakisefalik olmayan küçük ırk köpekler ve brakisefalik küçük ırk köpekler. Dördüncü grup ise kedileri içermekteydi. Bakteriler Illumina platform kullanılarak 16S rRNA sekanslama (V3 ve V4 çokdeğişken bölgeler) temeline göre belirlendi. Üç grup köpekte operasyonel taksonomik birimlerin sayısı küçük olmayan ırk köpekler, brakisefalik küçük ırk köpekler ve brakisefalik olmayan küçük ırk köpekler için sırasıyla 180, 190 ve 150 olarak tespit edilirken kedilerde 111 olarak belirlendi. Hem köpek hem de kedi diş taşlarında, Firmicutes filumu, özellikle de Clostridia sınıfı, en fazla okuma sayısına sahipti. PCoA ve UPGMA analizi köpek ve kedi diş taşlarının mikrobiyomu arasında farklılık olduğunu gösterdi. Elde edilen sonuçlar diş taşlarındaki bakteriyal topluluklarının ağız boşluğunun diğer taraflarından belirlenenlerden farklı olduğunu gösterdi. Diş taşları köpek ve kedilerde periodontal hastalıklar ile ilişkili bakterilerin büyümesi için uygun bir ortam oluşturabilir. Anahtar Kelimeler : Bakteri, Kedi, Köpek, 16S rRNA analizi, Diş taşı