Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Sayı 3
Analysis of Expressed Genes in Normal and Tumoral Mammary Gland Tissue of the Terrier Dog
Nehir OZDEMIR OZGENTURK1, Zehra OMEROGLU ULU1, Salih ULU1, Merve CELIK1, Burcin TELLIOGLU1, Funda YILDIRIM2, Iraz AKIS AKAD3, Aydın GUREL2, Cemal UN4, Kemal Ozdem OZTABAK3
1Department of Molecular Biology and Genetics, Faculty of Art and Science, Yıldız Technical University, TR- 34220 Istanbul - TURKEY
2Department of Pathology, Faculty of Veterinary Medicine, Istanbul University, TR-34320 Avcilar, Istanbul - TURKEY
3Department of Biochemistry, Faculty of Veterinary Medicine, Istanbul University, TR-34320 Avcilar, Istanbul - TURKEY
4Department of Molecular Biology and Genetics, Faculty of Science, Ege University, TR-35100 Bornova, Izmir - TURKEY
DOI : 10.9775/kvfd.2017.18964 Meme bezi tümörü, dişi köpeklerde en sık rastlanan tümör türüdür. Tümör oluşumu ve tümör oluşum mekanizması ile ilgili genler hakkındaki veriler yetersizdir. Köpekteki tümörigenez çalışmalarının insan meme bezi tümörleri için bir model olabileceğini görmek için karşılaştırmalı çalışmalar yürütülmüştür. Bu çalışmada, sağlıklı bir Terrier köpeğinin normal meme dokusundan ve hasta bir köpekten tümörlü meme dokusundan toplanan iki farklı dokudan iki farklı cDNA kütüphanesi oluşturuldu. Bir köpek meme bezi EST kolleksiyonu geliştirmek için, iki kütüphaneden rastgele seçilen toplam 2304 koloni dizilendi. Ham EST verileri Phred/Phrap programları ile analiz edildi ve okunabilir EST dizileri CAP3 programı ile bir araya getirildi. Tüm EST dizileri 45 kontig ve 2203 singlet grubuna ayrıldı. Tüm benzersiz sekansların varsayımsal fonksiyonları, NCBI BLAST tarafından gen homolojisine dayalı olarak belirlendi ve BLAST2GO ile açıklandı. Bu çalışmanın sonuçları, köpeklerin fonksiyonel genom çalışmaları için çok değerli bir kaynaktır. Anahtar Kelimeler : Terrier, Köpek, Meme Kanseri, EST, cDNA kütüphanesi