Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2020 , Vol 26 , Sayı 2
Genetic Characterization of Gigantocotyle explanatum from Buffaloes in Northwestern Pakistan
Sana ULLAH1, Kiran AFSHAN1, Muhammad ARSHAD1, Sabika FIRASAT1
1Department of Animal Sciences, Faculty of Biological Sciences, Quaid-i-Azam University Islamabad, 45320, PAKISTAN DOI : 10.9775/kvfd.2019.22777 Gigantocotyle explanatum"un da dahil olduğu Paramphistomidae familyası ruminantları sistemli olarak enfekte ederek süt üretimi ve büyüme oranlarını azaltır ve hayvancılık endüstrisinde büyük ekonomik kayıplara neden olur. Bu çalışmada Pakistan"da G. explanatum"un yeni moleküler verilerinin ribozomal DNA (ITS1-5.8S, ITS2) bölgeleri kullanılarak belirlenmesi amaçlandı. Yetişkin G. explanatum kurtçukları, enfekte bufaloların safra kanallarından toplandı. Dünyanın diğer bölgelerindeki en yakın gen dizileri GenBank"tan indirildi. ITS1 geninin 5"- uç bölgesinde yüksek intraspesifik varyasyonlar elde edildi. ITS1"in 3"- ucu korundu ve Paramphistomum cervi (KJ459936) ile %96 oranında benzerlik belirlendi. 5.8S geninin nükleotit BLAST araştırması, trematodlardan elde edilen 40 sekansın, mevcut sekans ile %98 ila %99 özdeşliğe sahip olduğunu ve genetik olarak Çin"den P. cervi (KJ459938) ve Dicrocoelium chinensis (KF734784) ile benzer olduğunu gösterdi. İncelenen izolatların ITS2 geni, Myanmar (AB743577) ile hiçbir farklılık göstermezken, BLAST araştırması, Myanmar, Hindistan, Bangladeş ve Çin"den elde edilen izolatlarla %96-100 oranında benzerlik gösterdiğini ortaya koydu. Bu çalışma, ITS2 ve ITS1 3"- uç dizilerinin Güney Asya"daki türlerin filogenetik ilişkisinin aydınlatılmasında değerli bir araç olduğunu göstermektedir. Bu veri dizini, G. explanatum"un daha doğru bir şekilde tanımlanmasını kolaylaştıracak ve bu türlerle ilgili literatürdeki birçok belirsizliğin çözülmesinde yeni araştırmalara olanak sağlayacaktır. Anahtar Kelimeler : Gigantocotyle explanatum; Su bufalosu, Pakistan, Genetik karakterizasyon