Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2022 , Vol 28 , Issue 4
Molecular Detection of Picornaviruses in Diarrheic Small Ruminants at a Glance: Enterovirus, Hunnivirus, and Kobuvirus in Türkiye
Ilke KARAYEL-HACIOGLU1, Selda DURAN-YELKEN2, Feray ALKAN1
1Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Virology, TR-06110 Ankara - TÜRKİYE
2Siirt University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Virology, TR-56100 Siirt - TÜRKİYE
DOI : 10.9775/kvfd.2022.27656 Enterik hastalıklar, hayvancılık endüstrisini etkileyen önemli bir faktör olarak kabul edilmektedir, ancak ülkemizde küçük ruminantlarda enterik hastalıklara neden olan viruslara ilişkin veriler sınırlıdır. Bu çalışmada Picornaviridae ailesinin üyeleri olan enterovirus (EV), hunnivirus (HuV) ve kobuvirus (KoV) üzerinde durulmuştur. Bu virusların prevalansı ve moleküler epidemiyolojisi hakkında daha fazla bilgi elde etmek amacıyla, ishalli koyun ve keçilerden toplam 73 dışkı örneği veya bağırsak içeriği EV, HuV ve KoV için test edilmiştir. Bu amaçla, her bir virus için spesifik primerler kullanılarak RT-PCR"lar yapılmıştır. Örneklenen popülasyonda tespit edilen prevalans oranı her bir virus için %2.7 (2/73) olarak hesaplanmıştır. Detaylı olarak değerlendirildiğinde, EV (2/60, %3.3) ve HuV (2/60, %3.3) yalnızca koyun örneklerinde saptanırken, KoV ise bir keçi (1/13, %7.6) ve bir koyun örneğinde (1/60, %1.6) tespit edilmiştir. Bununla birlikte, test edilen hayvanlarda bu viruslarla herhangi bir koenfeksiyon saptanmamıştır. Moleküler analizlerin sonuçlarına göre, EV suşlarının keçi/koyuna özgü EV-G"de kümelendiği ve bu çalışmada elde edilen HuV suşlarının ise Hunnivirus A2 genotipinde diğer keçi/koyun kökenli dizinlerle birlikte gruplandığı ortaya konulmuştur. Ayrıca tespit edilen KoV suşlarının Aichivirus B ve Aichivirus C olmak üzere farklı türlerde kümelendiği gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, ülkemizde koyun ve keçilerde KoV"ların yanı sıra koyunlarda EV ve HuV"un tespitini bildiren bu çalışma, bu virusların epidemiyolojisi ve moleküler özelliklerine ilişkin değerli veriler sunmaktadır. Keywords : Enterovirus, Hunnivirus, Keçi, Kobuvirus, Koyun