Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2021 , Vol 27 , Issue 4
Comparative Analysis of the Heart Tissue Transcriptomes Between Low-altitude Reared and High-altitude Reared Bar-headed Geese (Anser indicus)
Ying LI1, Fang WANG2, Xiaolong GAO1, Lilin ZHU3, Wen WANG1, Kirill SHARSHOV4
1State Key Laboratory of Plateau Ecology and Agriculture, Qinghai University, Xi’ning 810016, Qinghai Province, CHINA
2Northwest Institute of Plateau Biology, Chinese Academy of Sciences, Xi’ning 810008, Qinghai Province, CHINA
3Xi’ning wild animal epidemic disease monitoring station, Xi’ning 810001, Qinghai Province, CHINA
4Federal Research Center of Fundamental and Translational Medicine, Novosibirsk 630117, RUSSIA DOI : 10.9775/kvfd.2020.25704 Çubuk başlı kazlar (Anser indicus), yüksek irtifada göçmen uçuşlarıyla ünlüdür ve yıllık göçleri için Tibet Platosu üzerinden uçmaları gerekir. Yüksek irtifaya adapte çubuk başlı kazları, diğer yakından ilişkili alçak irtifalı türlerle karşılaştırarak, bu kazların yüksek irtifa koşullarında yaşamasına ve uçmasına yardımcı olan fizyolojik, biyokimyasal ve davranışsal seviyelerde benzersiz adaptasyonlarını ortaya çıkaracak birçok çalışma yapılmıştır. Bununla birlikte, çubuk başlı kazların alçak irtifalı ortamlara adaptasyonlarının transkriptom seviyesi değişiklikleri ile ilgili çok az şey bilinmektedir. Çubuk başlı kazlarda düşük irtifa ortamı tarafından indüklenen gen ekspresyon varyasyonlarını araştırmak için, yüksek irtifa bölgelerinde (~3000 m) yetiştirilen çubuk başlı kazlar arasındaki kalp dokularının ilk karşılaştırmalı transkriptomik analizini gerçekleştirdik ve bu kazlar yaklaşık üç yıl boyunca alçak irtifalı bölgelerde (~30 m) yetiştirildi. Yüksek irtifalı çubuk başlı kazlarla karşılaştırıldığında, alçak irtifalı çubuk başlı kazlarda farklı eksprese edilmiş (DEG) toplam 76 gen tespit edildi. Gen ontolojisi (GO) ve Kyoto Genler ve Genom Ansiklopedisi (KEGG) analizi, bu DEG"lerin temel olarak fokal adezyon, ekstrasellüler matris (ECM) - reseptör etkileşimi, rapamisin protein kompleksinin memeli hedefi (mTOR) sinyal yolu, wingless-tip (Wnt) sinyal yolu ve glikozaminoglikan degredasyonu vb. ile ilişkili oduğunu göstermiştir. Çalışma sonuçları, çubuk başlı kazların farklı irtifa ortamlarına farklı adaptasyonlarını anlamak için faydalı olacaktır ve elde edilen transkriptom verileri gelecekteki fonksiyonel çalışmalar için değerli bir kaynak imkanı sunacaktır. Keywords : Anser indicus, Transkriptom, Adaptasyon, İrtifa, Kalp