This journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2021 , Vol 27 , Issue 3
The Effects of MBL1 Gene Polymorphism on Subclinical Mastitis in Holstein Cows
1Erciyes University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Genetics, TR-38039 Kayseri - TURKEY2Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Biostatistics, TR-06110 Ankara - TURKEY
3Erciyes University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Biometrics, TR-38039 Kayseri - TURKEY DOI : 10.9775/kvfd.2021.25714 Bu çalışma, MBL1 geninde bulunan üç tek nükleotid polimorfizminin (SNP) Holstein ineklerinde subklinik mastitis üzerine etkilerini incelemeyi amaçlamaktadır. Çalışma için üçüncü laktasyonlarında olduğu bildirilen toplam 151 Holstein inek seçilmiştir. Subklinik mastitis kondüsyonları California Mastitis Testi (CMT) kullanılarak belirlenmiştir. Genotipleme PCR-RFLP yöntemi kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Sonuç olarak doğal tip allel frekanslarının 1252 G> A, 2534 G>A ve 2569 T>C SNP"leri için sırasıyla 0.72 (G allel), 0.40 (G allel) ve 0.37 (T allel) olduğu belirlenmiştir. İncelenen SNP"ler arasında sadece 1252 G>A SNP"sinin Hardy-Weinberg dengesinde olmadığı belirlenmiştir. SNP"lerin subklinik mastitis üzerindeki etkileri, Çok Değişkenli Lojistik Regresyon Analizi kullanılarak modellenmiştir. Oluşturulan model, subklinik mastitisli inekleri %62.3 verimlilikle belirleyebilmektedir. 1252 G>A ve 2534 G>A SNP"lerin subklinik mastitis oranları için etkili faktörler olabileceği düşünülmüştür. Keywords : Çok değişkenli lojistik regresyon analizi, İnek, MBL1, SNP, Subklinik mastitis