This journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2021 , Vol 27 , Issue 2
High-throughput Sequencing Analysis of miRNA Expression in Embryonic Chicken Breast Muscle
1College of Animal Science and Technology, Shihezi University, Shihezi, 832000, CHINA
DOI :
10.9775/kvfd.2020.25033
Embriyonik dönem, tavuklarda kas ve yağ dokusunun gelişimi için kritik bir dönemdir. MikroRNA (miRNAs)"ların çeşitli biyolojik süreçlerde
önemli roller üstlendikleri gösterilmiştir, fakat tavuk embriyolarında miRNA"lar hakkında çok az şey bilinmektedir. Yetişkin tavuklarda et
kalitesini düzenleyen işlevsel miRNA"ları araştırmak için Cobb broylerlerinin (CB) ve gül taçlı tavukların (RC) embriyonik göğüs kas dokuları
toplandı ve yüksek verimli küçük RNA dizi analizleri gerçekleştirildi. Sonuçlar, 592"si farklı olarak eksprese olan (DE) miRNA"lar (P <0.05)
olmak üzere 842 bilinen miRNA ve 598 yeni miRNA"nın dört sekans kütüphanesinden tanımlandığını gösterdi. Cobb broylerleri referans
alındığında, 321 miRNA"nın ekspresyonu artmış ve 271 miRNA"nın ekspresyonu azalmıştır. Real-time PCR analizi, farklı olarak eksprese olan
miRNA"lardaki eğilimlerin dizileme sonuçlarıyla tamamen tutarlı olduğunu doğruladı. Farklı olarak eksprese olan miRNA"ların 120,666 hedef
genini belirledik ve fonksiyonel zenginleştirme analizi, bu genlerin esas olarak Wnt sinyal yolağı, Adherens bağlantısı, Butirosin biyosentezi,
neomisin biyosentezi ve Hedgehog sinyal yolağında yer aldığını ortaya çıkardı. Ayrıca, miRNA"lar ve hedefl eri arasında düzenleyici etkileşim
ağları oluşturuldu ve ikili lusiferaz analizi ile yağ asidi bağlayıcı protein 5 (FABP5), miR-3532-5p"nin bir hedefi olarak doğrulandı. Bu çalışmaya
ait bulgular, tavuk kası miRNA ekspresyonu ile ilgili verileri zenginleştirdi ve genlerin miRNA aracılı regülasyonunun ve miRNA ile tavuk eti
kalite özellikleri arasındaki bağlantının daha fazla analizi için bir temel oluşturdu.
Keywords :
Cobb broyleri, Gül taçlı tavuk, miRNA, Et kalitesi, Embriyo, Yüksek verimli dizi analizi