Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2020 , Vol 26 , Issue 3
Comparison of Culture and PCR for Detection of Field Isolates of Bovine Milk Mollicutes
Abd Al-Bar AL-FARHA1, Farhid HEMMATZADEH2, Rick TEARLE3, Razi JOZANI4, Andrew HOARE5, Kiro PETROVSKI6
1Department of Animal Production, Technical Agricultural College, Northern Technical University, Mosul, IRAQ
2University of Adelaide, School of Animal and Veterinary Sciences, South Australia, AUSTRALIA
3Davies Centre, The University of Adelaide, School of Animal and Veterinary Sciences, South Australia, AUSTRALIA
4Tabriz University, Department of Veterinary Clinical Sciences, Tabriz, IRAN
5South East Vets, South Australia, AUSTRALIA
6Australian Centre for Antimicrobial Resistance Ecology, The University of Adelaide, School of Animal and Veterinary Sciences, South Australia, AUSTRALIA
DOI : 10.9775/kvfd.2019.23106 Mycoplasma mastitisleri dünya çapında süt endüstrisinde önemli sorunlara yol açmaktadır. Çalışmanın amacı, Mycoplasma ve Acholeplasma türlerinin saha izolatlarının tanımlanması için doğru ve hızlı bir tarama yöntemi geliştirmek ve inek sütünde Mycoplasma ve Acholeplasma türlerinin saptanması için PCR tabanlı yönteme karşı geleneksel mikrobiyal kültürün göreceli değerlerini araştırmaktı. Güney Avustralya"daki tek bir süt çiftliğinden toplanan toplam 368 bireysel süt örneğinden 192 (%52)"sinde geleneksel kültür bazlı yöntem ile molliküt varlığı pozitif bulundu. Doğrudan sütten ekstrakte edilen DNA, özel olarak tasarlanmış evrensel molliküt PCR bazlı yöntemle amplifikasyon için kullanıldı. Bu örneklerden 269"u (%73) pozitif bulundu. 16S rRNA genini hedefleyen 30 pozitif örneğin sekanslama sonuçlarına göre, Acholeplasma laidlawii, Acholeplasma axanthum, Mycoplasma arginini, Mycoplasma bovirhinis, Mycoplasma bovis olmak üzere beş farklı molliküt türü belirlendi. Bu sonuçlara göre, tüm numuneler üzerinde türe özgü PCR gerçekleştirilmiştir. Türe özgü PCR kullanılarak gerçekleştirilen DNA amplifikasyonları 256 (%70) örnekte molliküt pozitif sonuç verdi. Geliştirilen evrensel PCR, türe özgü PCR ile en iyi uyumu gösterdi (Cohen"s Kappa = 0.747±0.031). Yukarıda belirtilen mollikütlerin iki veya daha fazlasının birlikte enfeksiyonu yüksek prevalans gösterdi. Bu çalışmada mollikütlerin araştırılmasında evrensel PCR kullanımı önerilmektedir. Çalışmada kullanılan PCR sistemi, süt sığırcılığında Mycoplasma ve Acholeplasma türlerinin taranmasında geleneksel bakteriyolojik kültür yöntemine kıyasla önemli bir hız ve hassasiyet göstermiştir. Keywords : Mycoplasma, Mastitis, Süt sığırı, Acholeplasma