Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2020 , Vol 26 , Issue 3
Phylogenetic Grouping and Antimicrobial Resistance Profiles of Escherichia coli Isolated from Calves in Xinjiang, China
Xingxing ZHANG1, Jie LI1, Ling ZHANG3, Jun QIAO1, Qingling MENG1, Ying CHEN4, Kuojun CAI5, Xin HUANG2, Tongzhong WU2, Mengli HAN2, Fagang ZHONG2
1College of Animal Science and Technology, Shihezi University, Shihezi, Xinjiang, 832003, CHINA
2State Key Laboratory for Sheep Genetic Improvement and Healthy Production, Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science, Shihezi, Xinjiang, 832000, CHINA
3College of Animal Science and Technology, Tarim University, Alar, Xinjiang, 843300, CHINA
4College of Animal Science and Technology, Xinjiang Agricultural Vocational and Technical College, Changji, Xinjiang, 31100, CHINA DOI : 10.9775/kvfd.2019.23046 Yaygın çoklu ilaç dirençli Escherichia coli suşları, hayvan sağlığı ve üretim endüstrilerinin gelişimi için ciddi bir zorluk yaratmaktadır. Bu çalışmanın amacı, Çin"in Xinjiang eyaletindeki ishalli buzağılardan izole edilen E. coli"nin filogenetik gruplandırma ve antimikrobiyal direnç profilini araştırmaktı. Çalışmada, 379 adet ishalli buzağıdan alınan rektal sıvap örneğinden toplam 379 E. coli suşu izole edildi. Filogenetik gruplar ayrıca çoklu PCR ile analiz edildi ve A (%36.1), B1 (%17.4), B2 (%15.6) ve D (%30.9) olarak dört gruba kümelendi. Tüm E. coli izolatları, Kirby-Bauer (KB) yöntemiyle 15 antimikrobiyal maddeye karşı duyarlılıkları açısından test edildi. İzolatlar ampisiline karşı en yüksek direnç oranını gösterirken (%64.9), bunu streptomisin (%59.4), tetrasiklin (%53.8), sülfametoksazol/trimetoprim (%50.9), kloramfenikol (%45.6), kanamisin (%44.1) ve enrofloksasin (%42.0) izledi. E. coli izolatları seftazidime (%15.0) ve polimiksine (%12.6) daha düşük direnç gösterdi. E. coli izolatlarında direnç genleri blaTEM, blaOXA, mcr-1, strA-strB, aadA, tet(A), tet(B) ve tet(C) sırasıyla %68.3 (168/246), %27.2 (67/246), %14.6 (7/48), %51.1 (115/225), %24.9 (56/225), %51.5 (105/204), %44.6 (91/204) ve %7.8 (16/204) olarak belirlendi. Bu sonuçlar, Xinjiang bölgesindeki ishalli buzağılardan elde edilen E. coli suşlarında yaygın çoklu ilaç direnci ve yüksek düzeyde antimikrobiyal direnç genlerinin bulunduğunu ve potansiyel bir halk sağlığı sorunu teşkil ettiğini gösterdi. Keywords : Escherichia coli, Filogenetik gruplama, Antimikrobiyal direnç, Direnç genleri, Buzağı