This journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2020 , Vol 26 , Issue 2
Genetic Characterization of Gigantocotyle explanatum from Buffaloes in Northwestern Pakistan
1Department of Animal Sciences, Faculty of Biological Sciences, Quaid-i-Azam University Islamabad, 45320, PAKISTAN
DOI :
10.9775/kvfd.2019.22777
Gigantocotyle explanatum"un da dahil olduğu Paramphistomidae familyası ruminantları sistemli olarak enfekte ederek süt üretimi ve büyüme
oranlarını azaltır ve hayvancılık endüstrisinde büyük ekonomik kayıplara neden olur. Bu çalışmada Pakistan"da G. explanatum"un yeni
moleküler verilerinin ribozomal DNA (ITS1-5.8S, ITS2) bölgeleri kullanılarak belirlenmesi amaçlandı. Yetişkin G. explanatum kurtçukları,
enfekte bufaloların safra kanallarından toplandı. Dünyanın diğer bölgelerindeki en yakın gen dizileri GenBank"tan indirildi. ITS1 geninin 5"-
uç bölgesinde yüksek intraspesifik varyasyonlar elde edildi. ITS1"in 3"- ucu korundu ve Paramphistomum cervi (KJ459936) ile %96 oranında
benzerlik belirlendi. 5.8S geninin nükleotit BLAST araştırması, trematodlardan elde edilen 40 sekansın, mevcut sekans ile %98 ila %99 özdeşliğe
sahip olduğunu ve genetik olarak Çin"den P. cervi (KJ459938) ve Dicrocoelium chinensis (KF734784) ile benzer olduğunu gösterdi. İncelenen
izolatların ITS2 geni, Myanmar (AB743577) ile hiçbir farklılık göstermezken, BLAST araştırması, Myanmar, Hindistan, Bangladeş ve Çin"den
elde edilen izolatlarla %96-100 oranında benzerlik gösterdiğini ortaya koydu. Bu çalışma, ITS2 ve ITS1 3"- uç dizilerinin Güney Asya"daki türlerin
filogenetik ilişkisinin aydınlatılmasında değerli bir araç olduğunu göstermektedir. Bu veri dizini, G. explanatum"un daha doğru bir şekilde
tanımlanmasını kolaylaştıracak ve bu türlerle ilgili literatürdeki birçok belirsizliğin çözülmesinde yeni araştırmalara olanak sağlayacaktır.
Keywords :
Gigantocotyle explanatum; Su bufalosu, Pakistan, Genetik karakterizasyon