This journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2019 , Vol 25 , Issue 5
Comparison of Internal Transcribed Spacer Region Sequencing and Conventional Methods Used in the Identification of Fungi Isolated from Domestic Animals
1Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Microbiology, Şehit Ömer Halisdemir Bulvarı, TR- 06110 Dışkapı, Ankara - TURKEY
DOI :
10.9775/kvfd.2018.21506
Bu çalışmanın amacı, evcil hayvanlardan izole edilen mantar türlerinin identifikasyonunda altın standart olan konvansiyonel kültür yöntemi
ve Internal Ara Bölgeler (ITS) dizi analizi yönteminin karşılaştırılmasıdır. Çalışmada, mantar enfeksiyonlarından şüphelenilen toplam 35
hayvan (15 kedi, 11 köpek, 4 at ve 5 tavuk) incelendi. 35 örnek içinde 20 tanesinin mantar kültürleri pozitif bulundu. Pozitif örnekler arasında 8
(%40) tanesi konvansiyonel yöntemlerle ağırlıklı olarak dermatofit türleri olarak bulundu. İzolatların ITS bölgeleri (ITS1, ITS2 ve ITS bölgesinin
tamamı) amplifiye edildi, sekanslandı ve elde edilen sonuçlar kültür yöntemiyle karşılaştırıldı. Hem konvansiyonel hem de dizi analizi
yöntemiyle elde edilen identifikasyon sonuçları 18 (%90) örnekte birbiri ile uyumlu bulundu. Bu sonuçlar doğrultusunda, ITS bölgesinin
tamamının dizi analizi, mantarların hızlı teşhisi için kullanılabileceğini ortaya koydu. ITS gen bölgesinin tamamına ait dizi analizi sonuçlarının
fenotipik identifikasyon sonuçları ile uyumlu olması, ITS gen bölgesi dizi analizinin konvansiyonel yöntemlerin doğrulanmasında bir araç
olarak kullanılabileceğini ortaya koymuştur.
Keywords :
Dermatofit, Mantar, ITS dizileme