Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2019 , Vol 25 , Issue 5
Comparison of Internal Transcribed Spacer Region Sequencing and Conventional Methods Used in the Identification of Fungi Isolated from Domestic Animals
İnci Başak MÜŞTAK1, Seyyide SARIÇAM1, Hamit Kaan MÜŞTAK1
1Ankara University, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Microbiology, Şehit Ömer Halisdemir Bulvarı, TR- 06110 Dışkapı, Ankara - TURKEY DOI : 10.9775/kvfd.2018.21506 Bu çalışmanın amacı, evcil hayvanlardan izole edilen mantar türlerinin identifikasyonunda altın standart olan konvansiyonel kültür yöntemi ve Internal Ara Bölgeler (ITS) dizi analizi yönteminin karşılaştırılmasıdır. Çalışmada, mantar enfeksiyonlarından şüphelenilen toplam 35 hayvan (15 kedi, 11 köpek, 4 at ve 5 tavuk) incelendi. 35 örnek içinde 20 tanesinin mantar kültürleri pozitif bulundu. Pozitif örnekler arasında 8 (%40) tanesi konvansiyonel yöntemlerle ağırlıklı olarak dermatofit türleri olarak bulundu. İzolatların ITS bölgeleri (ITS1, ITS2 ve ITS bölgesinin tamamı) amplifiye edildi, sekanslandı ve elde edilen sonuçlar kültür yöntemiyle karşılaştırıldı. Hem konvansiyonel hem de dizi analizi yöntemiyle elde edilen identifikasyon sonuçları 18 (%90) örnekte birbiri ile uyumlu bulundu. Bu sonuçlar doğrultusunda, ITS bölgesinin tamamının dizi analizi, mantarların hızlı teşhisi için kullanılabileceğini ortaya koydu. ITS gen bölgesinin tamamına ait dizi analizi sonuçlarının fenotipik identifikasyon sonuçları ile uyumlu olması, ITS gen bölgesi dizi analizinin konvansiyonel yöntemlerin doğrulanmasında bir araç olarak kullanılabileceğini ortaya koymuştur. Keywords : Dermatofit, Mantar, ITS dizileme