Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Issue 6
Whole Genome Sequencing of the Dzo: Genetic Implications for High Altitude Adaptation, Sterility, and Milk and Meat Production
Jingcheng ZHONG1, Zhijie MA2, Zhixin CHAI1, Hui WANG1, Chengfu ZHANG3, Qiumei JI3, Jinwei XIN3
1Key Laboratory of Animal Genetics and Breeding, State Ethnic Affairs Commission and Ministry of Education, Southwest Minzu University, Chengdu, CHINA
2Qinghai Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University, Xining, CHINA
3Institute of Animal Science and Veterinary, Tibet Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences, Lhasa, CHINA DOI : 10.9775/kvfd.2018.20022 Evcil Yak ile Qinghai-Tibet platosunda bulunan sığırın bir hibriti olan Dzo artmış et ve süt üretimi ile birlikte aynı zamanda oldukça yüksek rakımlı bölgelere adaptasyonu nedeni ile ticari olarak önem arz etmektedir. Bu özgün evcil hibritin genomik yapısını ve uyum kapasitelerini daha iyi anlamak amacıyla tüm genom sekanslaması yapılarak genomik yapısı ve varyasyonlar Dzonun progenitörleri olan sığır ve Yak ile karşılaştırıldı. Dzo ile sığır referans genomları arasında toplam 33.17 M tek nükleotid varyasyonu belirlendi. Dzo steril olarak bilinmesine rağmen Dzo Y kromozomunda sterilite ile ilgili hiç bir genetik işarete rastlanmadı. Aksine, elde edilen bulgular otozomal DMC1 lokusunun (Kromozom 5. 110729098. C>CT) Dzonun sterilitesinde rol oynadığına işaret etmekte ve bu nedenle de daha ileri araştırılmaların yapılması gerekmektedir. Yüksek rakıma adaptasyon ile ilişkili yüksek oranda varyasyona sahip genlerin araştırılması amacıyla sığır ve Yakın tüm genom sekanslama verilerinin entegrasyonu gerçekleştirildi. Hipoksi ile indüklenebilir faktör 2α"yı kodlayan EPAS1 geni Yak ve sığır arasında yüksek varyasyon (Kromozom 11.28664187 C>T) göstermekteydi ve bu nedenle yüksek rakıma adaptasyonun genetik temelinde rol oynayabileceği düşünüldü. Ayrıca, Dzo, Yak ve sığır genomları arasındaki farklılıklar analiz edildiğinde, yüksek rakıma adaptasyon ile birlikte et ve süt üretimine etki eden bazı ilave genomik işaretlere rastlandı. Bu bulgular Qinghai-Tibet platosunda daha ileri ve devam ettirilebilir ruminant yetiştiriciliği için daha fazla çalışmalara ihtiyaç olduğunu göstermektedir. Keywords : Dzo: Genom sekanslama, Dzo, Yüksek rakım adaptasyonu, Sterilite, Süt ve et üretimi