¹Department of Biological Sciences, Nuclear Institute for Agriculture and Biology (NIAB), Faisalabad, affiliated with Pakistan Institute of Engineering and Applied Sciences (PIEAS), Islamabad, PAKISTAN DOI : 10.9775/kvfd.2017.18949 Bu çalışmada, 2011"den bu güne kadar Grup VII (Sind-08) içerinde yer alarak dolaşan virüslere vurgu yapılmak suretiyle serotip Asya1 virüslerinin (n = 131) kapsid proteinini kodlayan bölgesi analiz edildi. 2011-2017 yılları süresince elde edilen izolatların Grup VII (Sind-08)"nin yeniden çıkış gösteren topluluğu içerisinde gruplandığı tespit edildi. Bu topluluk için en güncel ortak atanın zamanı, yaklaşık 2004 olarak tahmin edildi. Grup VII (2001-2004)"nin eski izolatları ile karşılaştırıldığında, yeniden çıkış gösteren virüsler on dördüncü amino asit pozisyonunda antijenik olarak önemli rezidüler olan VP1140, VP1142 ve VP277"de yer değiştirmeleri içeren varyasyonlar göstermekteydi. Uluslararası tavsiye edilen aşı suşları (Shamir 89) ile karşılaştırıldığında, Grup VII (Sind-08)"de tüm üç majör antijenik bölgede (Bölge I ve II"de sırasıyla 140, 141 ve 77, 79 pozisyonlarında dört konsensüs değişiklik ve bölge IV"de pozisyon 59"da yer değiştirme) mutasyon bulunmaktaydı. Bu çalışma ile Şap Hastalığı Virüsü genomunun tüm kapsid kodlayan bölgesini (P1) içeren 2901 baz çifti bölgesini amlifiye etme ve sekanslamada yeni bir RTPCR metodunun geliştirilmesi ve optimizasyonu açıklanmıştır. Bu metot, salgınlarda aşı eşleştirme veya suş seçimine yardım etmek için Şap Hastalığı Virüsünün antijenik profili ve filogenetik analizi amacıyla kullanılabilir. Keywords : Şap Hastalığı, Pakistan, Diagnoz, Aşı