This journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2017 , Vol 23 , Issue 2
Evaluation of Analytical-Sensitivity and -Specificity of a Commercially Available One-Step Real-Time Polymerase Chain Reaction Assay Kit for the Detection of Burkholderia mallei
1Section of Epidemiology and Public Health, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, Sub-campus Jhang, PAKISTAN2Department of Wildlife and Ecology, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, PAKISTAN
3Friedrich-Loeffler-Institut, Bundesforschungsinstitut für Tiergesundheit Naumburger Straße 96a, 07743, Jena, GERMANY
4Department of Biosciences, COMSATS Institute of İnformation Technology (CIIT), Park Road, Chakh Shahzad, Islamabad, PAKISTAN
5Department of Clinical Medicine and Surgery, University of Agriculture, Faislabad, PAKISTAN
6Department of Clinical Medicine and Surgery, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore, PAKISTAN
7Department of Hygiene and Zoonoses, Faculty of Veterinary Medicine, Mansoura University, Mansoura 35516, EGYPT DOI : 10.9775/kvfd.2016.16518 Burkholderia mallei (B. mallei) ruamın etiyolojik ajanı olup, hastalık tek tırnaklıların oldukça enfeksiyöz ve bulaşıcı bir hastalığıdır. B. mallei"nin hızlı ve doğru tespiti ve ruamın diagnozu hem insanlar hem de hayvanlar için önemlidir. Bu çalışma, B. mallei"nin tespitinde ticari olarak satılan tek-basamaklı gerçek-zamanlı (RT) PCR kitinin (Genekam Biotechnology AG, Almanya) analitik özgünlüğü ve özgüllüğünün değerlendirilmesi amacıyla yapılmıştır. Daha önceden yayınlanmış olan fliP RT-PCR protokolü ile mevcut test edilen kitin özgünlüğü ve özgüllüğünün karşılaştırılması gerçek-zamanlı PCR, Mx3000P TM (Stratagene®, Kanada) ile yapıldı. Diagnostik parametreler 20 B. mallei, 20 B. pseudomallei, 15 B. mallei alakalı ve 10 klinik olarak ilgili Burkholderia olmayan türler ile değerlendirilirdi. Mx3000PTM platformunda tek basamaklı RT-PCR uygulayarak tespit etme limiti (LOD) 10 fg olarak belirlendi. Mx3000PTM platformu kullanılarak uygulanan fliP RT-PCR ile LOD 100 fg olarak belirlendi. Tek basamaklı RT-PCR"ın B. mallei suşları için spesifik olduğu sonucuna varıldı. Tek basamaklı RT-PCR kiti, kültürden B. mallei"nin spesifik olarak identifiye edilmesi ve belirlenmesinde kullanılabilecek hızlı geri dönüş zamanına sahip güçlü, hızlı, güvenilir, spesifik ve hassas bir üründür. Keywords : Burkholderia mallei, Analitik özgüllük, Analitik özgünlük, Tek basamaklı RT-PCR kiti