Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2017 , Vol 23 , Issue 2
Genomic Analysis of Endogenous Retrovirus Elements in Chinese Flocks of Economic Importance
GU YF1, LI TF1, LIANG XY1, FANG SG1, YANG YY1
1College of Animal Science, Yangtze University, No. 88 Jingmi Rd., Jingzhou, Hubei, 434025, P.R. CHINA DOI : 10.9775/kvfd.2016.16356 Çin tavuklarında endojen retrovirüs elemanlarının durumu henüz bilinmediğinden, Çin genelindeki 10 farklı tavuk ırkına ait embriyolu yumurta analiz edildi. Sunulan çalışmada, Çin"de ekonomik açıdan önemli tavuk sürülerinin embriyolarındaki EAV, ev, ev/J ve ARTCH"yi kapsayan endojen retrovirüs elemanları analiz edildi. Bu sonuçlar, test edilen tavuk ırklarındaki EAV genomik dizisinin E51 ve EAV- 0 ile karşılaştırıldığında EAV-0 ile daha yakın ilişkili olduğunu gösterdi. Çin tavuklarındaki ART-CH elemanları, prototip ART-CH klonları 5 ve 14"ten önemli düzeyde farklı değildi. Test edilen tavuk ırklarındaki ev ve ev/J nükleotid asit dizileri, diğer bilinen ev ve ev/J dizilerine benzer idiyse de, filogenetik ağacın farklı dallarına aitti (Lohmann Brown yumurtacıları ve Beyaz Leghorn"lar hariç). Ek olarak, sağlam ev/J sekansları, bu tavukların birbirinden biraz farklı olduğunu gösterdi. Bildirilen sonuçlar, endojen ALV"lerin bir kaç Çin tavuk ırkı arasında yaygın şekilde dağıldığını göstermektedir. Çin tavuk ırklarında mevcut endojen viral genomlar tavuk popülasyonları içinde dolaşan diğer endojen virüslerden genetik olarak farklıdır. Keywords : Kuş leukosis virüsü, Endojen retrovirüs, Tavuk, Genetik farklılık, Prevalans