This journal is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License
Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi
2023 , Vol 29 , Issue 2
Study on the Skeletal Muscle Transcriptomics of Alxa Gobi Camel and Desert Camel
1College of Veterinary Medicine, Inner Mongolia Agricultural University, Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Technology in Animal Disease, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Hohhot, 010018, P.R. CHINA2Animal Disease Prevention and Control Centre of Ejina Banner, Dalaihub Town, Alxa League, Inner Mongolia Autonomous Region, 735400, P.R. CHINA
3Comprehensive Support and Technology Promotion Centre of Yingen Sumu, Alxa Left Banner, Alxa League, Inner Mongolia Autonomous Region, 750323, P.R. CHINA
4Animal Husbandry and Veterinary Technology Promotion Centre of Alxa League, East Side of Yabrai Road, East City District, Bayanhot Town, Alxa Left Banner, Alxa League, Inner Mongolia Autonomous Region, 750306, P.R. CHINA DOI : 10.9775/kvfd.2023.29002 Alxa Gobi devesi ile Çöl devesi arasında et üretim performansındaki farkın nedenlerini araştırmak amacıyla, iki tür arasındaki iskelet kası gen ekspresyonunu karşılaştırmak için yüksek verimli transkriptom dizileme teknolojisi, HTSeq, DEGseq ve Gen Ontolojisi (GO) ve Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) veri tabanlarını kullandık. Toplam 484 sınıflandırma öğesi, Gen Ontolojisi (GO) işlevi ile önemli ölçüde zenginleştirildi, ki bunların 246"sı biyolojik süreçlerle ilgiliydi ve %50,8"ini oluşturuyordu. Bunların 184"ü moleküler işlevle ilgiliydi ve %38,1"ini oluşturuyordu. Elli dördü ise hücre bileşenleriyle ilgiliydi ve %11,1"ini oluşturuyordu. Gen Ontolojisi (GO) işlevi, 339 upregüle gen ve 108 downregüle gen için önemli ölçüde zenginleştirildi. Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) veri tabanında 6116 farklı eksprese edilmiş gen bulunmaktaydı. Yolak önem zenginleştirme analizi, bu genlerin 250 biyolojik metabolik yolakta yer aldığını, bunlardan 19"unun son derece önemli farklılıklara sahip olduğunu, 37"sinin iskelet kası gelişiminde ve 13"ünün yağ metabolizmasında yer aldığını ortaya koydu. Sonuçlar, Alxa Gobi devesinin uzun evrimsel süreç boyunca Alxa Çöl devesine kıyasla iskelet kası gelişimi ve yağ birikimi ile ilgili daha fazla gen ve sinyal yolu geliştirdiğini, bunun da Alxa Gobi devesinin özelliklerini değiştirdiğini ve et performansını artırdığını göstermiştir. Keywords : Alxa Bactrian devesi, Gen ontolojisi, Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi, İskelet kası transkriptomiği