Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Issue 3
Genetic Characterization of Porcine Parvovirus 7 (PPV7) Isolates in Fujian, China
Ru-Jing CHEN1, Ting-Ting LAI2, Qiu-Yong CHEN1, Xue-Min WU1, Yong-Liang CHE1, Shan YAN1, Chen-Yan WANG1, Long-Bai WANG1, Lun-Jiang ZHOU1
1Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Fujian Academy of Agriculture Sciences/Fujian Animal Disease Control Technology Development Center, Fuzhou 350013, CHINA
2FuZhou Da Bei Nong Biotech, Fuzhou 350013, CHINA
DOI : 10.9775/kvfd.2017.19202 Bu çalışmada, Güneydoğu Çin"in Fujian Eyaletinde elde edilen domuz parvovirus 7 (PPV7) izolatlarının tüm genomu sekanslandı ve analiz edildi. Genomik karşılaştırmada Fujian"dan elde edilen PPV7 izolatlarının diğer PPV7 suşları ile yüksek nükleotid benzerlik (%98.5"den daha fazla) göstererek yakın ilişkili olduğu gözlemlendi. NS temelli filogenetik analiz PPV7"nin Parvovirinae alt familyasına yakın farklı topluluk oluşturduğunu (Chapparvovirus olabileceği önerilen) gösterdi. Ancak, genom ve VP temelli filogenetik analiz PPV7 izolatlarının Densovirinae alt familyasına daha yakın topluluk oluşturduğunu gösterdi. Rekombinasyonun gözlemlenmemesi nedeniyle PPV7"nin genetik farlılıklarının oluşmasında rekombinasyonun katkısının olmadığı belirlendi. Bu bulgular, Çin"de PPV7"nin halen mevcut olduğunu göstermiş ve domuz parvovirusunun kalıtsal farklılaşmasını anlamamıza yardımcı olabilir. Keywords : Domuz parvovirus 7, Genomik karşılaştırma, Filogenetik analiz