Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2018 , Vol 24 , Issue 2
Molecular Detection of Selected Genetic Polymorphisms in Growth Hormone and Insulin Like Growth Factor 1 Genes in Indigenous Sudanese Baggara Cattle
Romaz Mohammed Ahmed OMER1, Mai Abdul Rahman Mohammed MASRI2, Khaleel Ibrahem Jawasreh3, Ikhlas Ahmed NOUR1, Ahmed Dayain Abdalla BIRAIMA4, Lutfi Mohamed-Ahmed MUSA5, Mohamed-Khair Abdalla AHMED5
1Institute of Studies and Promotion of Animal Exports, University of Khartoum, SUDAN
2Department of Zoology, Faculty of Science University of Khartoum, SUDAN
3Department of Animal Productions, Faculty of Agriculture- Jordan University of Science and Technology, JORDAN
4Department of meat Production, Faculty of Animal Production, University of Khartoum, SUDAN
5Department of Genetics and Animal Breeding, Faculty of Animal Production, University of Khartoum, SUDAN
DOI : 10.9775/kvfd.2017.18556 Bu çalışma bölgesel olarak farklı iki (Nyalawi ve Mesairi) Sudan Baggara zebu sığırlarından toplam 127 boğa üzerinde gerçekleştirilmiştir. Çalışmanın amacı bu iki farklı ırk arasında büyüme hormonu geni (M57764) ve insülin benzeri büyüme faktörü 1 genindeki (000162.1) polimorfizmi araştırmaktır. DNA örneklerinde genotiplendirme için PCR-RFLP kullanıldı. Seçili örneklerde genotiplendirmenin doğrulunu kontrol etmek amacıyla DNA sekanslaması kullanıldı. Mevcut sekanslar BioEdit ve MEGA6 yazılımları kullanılarak analiz edildi. Her iki Baggara sığır ırkında bazı popülasyon genetiği ölçümleri araştırıldı. PCR-RFLP sonuçları her iki Baggara sığır ırkında GH1 geninin 2141C>G pozisyonunda yüksek genetik benzerlik olduğunu ortaya koydu (monomorfik atasal allel C/C görünümü). Her iki ırk arasında IGF-1 geninin -472C>T pozisyonu bakımından bir fark belirlenmedi. Sadece 0.016 sıklıkta olmak üzere Mesairi ırkında mutat homozigot (TT) belirlendi. Düşük allel sıklıklarında olmak üzere (0. 068 Nyalawi ırkında ve 0.079 Mesairi ırkında) heterozigot (CT) genotip mevcuttu. Ayrıca, GH1 geninin ekson 5 bölgesinde üç mutasyon tespit edildi. Bunlardan ikisi 2230 (C>T) ve 2291(A>C) pozisyonlarında sessiz mutasyon ve diğeri 2258 (C/T) pozisyonunda geçiş mutasyonuydu. Sonuç olarak, her iki ırkın incelenen hedef poziylonlar bakımından genetik olarak benzer oldukları belirlendi. GH1 geninin ekson 5 bölgesinde tespit edilen mutasyon (2258 (C/T) ileriki çalışmalarda değerlendirilmelidir. Keywords : Nyalawi, Mesairi, Polimorfizm, IGF-1, GH1