Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 2017 , Vol 23 , Issue 4
Genotypic, Antimicrobial Resistance and Virulence Profiles of Thermophilic Campylobacter Isolates in Broilers
Özkan ASLANTAŞ1
1Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, Mustafa Kemal University, TR-31040 Hatay - TURKEY DOI : 10.9775/kvfd.2016.17261 Bu çalışmanın amacı, Adana ve Hatay illerindeki ticari broyler çiftliklerinde Campylobacter jejuni ve Campylobacter coli"nin prevalansını, antimikrobiyal direnç ve genetik belirleyicilerini araştırmaktır. İzolatlar arasındaki genetik çeşitliliğin değerlendirilmesi, flaA geninin DdeI restriksiyon endonükleaz enzimi ile kesilmesine dayalı RFLP-Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve flaA ve flaB-SVR genlerinin kısa değişken bölgelerinin (SVR"ler) dizi analizi ile belirlendi. Ayrıca, izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon yöntemi ile yapıldı ve tetrasiklin (tetO), ampisilin (blaOXA-61), aminoglikozid (aph-3-1) ve çoklu dirence aracılık eden efluks pompası (cmeB) direnç genlerinin varlığı ise PZR ile araştırıldı. Siprofloksasine dirence neden olan mekanizmalar PZR ve takiben DNA dizi analizi ile araştırıldı. İzolatlar arasında 10 virulans (flaA, virB11, racR, cadF, ciaB, dnaJ and pldA) ve toksin geninin (cdtA, cdtB, cdtC) varlığı PZR ile incelendi. İncelenen 220 kloakal sıvabtan 194"ü C. jejuni (%89) ve 24"ü C. coli (%11) olmak üzere 218 (%99.1) Campylobacter spp. izole edildi. Tüm izolatlar kloramfenikol, gentamisin ve eritromisin"e duyarlı iken; C. jejuni ve C. coli izolatlarının nalidiksik asit, siprofloksasin, ampisilin, tetrasiklin ve amoksisilin-klavulanik asite direnç oranları sırasıyla %86.6-100, %86.6-100, %45.9-45.8, %43.3-50 ve %2.6-0.0 olarak belirlendi. C. jejuni ve C. coli izolatlarında tetO, blaOXA-61, cmeB ve aph-3-1 genlerinin prevalansı sırasıyla %45.3-54.4, %36.1-75, %1.5-83.3 ve %0.5-0 tespit edildi. C. jejuni ve C. coli izolatlarında flaA, cdtA, cdtB, cdtC, racR, cadF, ciaB, dnaJ ve pldA genlerinin prevalansı ise sırasıyla %100-100, %95.4-100, %94.3-100, %89.7-54.2, %89.2-79.2, %92.8-100, %67-16.7, %85.6-75 ve %80-66.7 olarak belirlendi. virB11 geni Campylobacter izolatlarının hiçbirinde tespit edilmedi. Tüm flaA ve flaB -SVR allelleri aynı PCR-RFLP patternleri gösterdi. Bu çalışmanın sonuçları broyler sürülerinde Campylobacter spp. prevalansının, patojenik potansiyelinin, genetik çeşitliliğinin ve antimikrobiyal direnç oranlarının yüksek olduğunu göstermektedir. Bu durum antimikrobiyallere dirençli Campylobacter"lerin ortaya çıkışını ve yayılımını azaltmak için etkili kontol önlemlerinin acilen uygulanması gerektiğini vurgulamaktadır. Keywords : Termofilik Campylobacter, Antimikrobiyal direnç, Virulens, Genotiplendirme